forge.ird.fr / diade / culebront_pipeline
dojo snakemake assemblage long reads
JSON API: https://ecosystem.code.gouv.fr/api/v1/hosts/forge.ird.fr/repositories/diade%2Fculebront_pipeline
étoiles: 2
forks: 0
issues ouvertes:
licence: gpl-3.0+
langage:
dépendances analysées:
15
date de création: il y a plus de 3 ans
date de mise à jour: il y a environ un an
enregistré: il y a environ un an
dernière synchronisation: il y a 9 mois
Sujets: Genome assembly, Next-Generation Sequencing, Quality Control, Snakemake, reports
- snakemake *
- sphinx-rtd-theme ==1.2.0
- sphinx_copybutton *
- toml *
pyproject.toml
pypi
- biopython *
- ipython *
- matplotlib *
- nbformat *
- numpy *
- pandas *
- pysam *
- setuptools >=68.2.0
- snakecdysis >=1.0.0
- snakemake <=8
- tabulate *