An open API service providing repository metadata for many open source software ecosystems.

GitHub / openalea 71 Dépôts

OpenAlea is an open source project aimed at the plant research community. It includes modules to analyse and model growth and functioning of plant architectures

openalea/WheatFspm

WheatFspm is a Functional Structural Plant Model (FSPM) of wheat based on an innovative modelling framework for a better understanding of grass morphogenesis and C-N economy in interaction with environmental conditions.

langage: Python - taille: 34,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a environ 2 mois - étoiles: 13 - forks: 8

openalea/cookiecutter-openalea

Project template for openalea projects, designed according to openalea development guidelines

langage: Makefile - taille: 43,9 ko - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a 3 jours - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/action-build-publish-anaconda

langage: Shell - taille: 670 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 5 - forks: 2

openalea/metafspm

Base classes for FSPM processes to define inputs, variables and components

langage: Python - taille: 294 ko - dernière synchronisation: il y a 1 jour - enregistré: il y a 3 jours - étoiles: 0 - forks: 1

openalea/adel

Characterization of 3D plant development for graminae crops

langage: Python - taille: 38,7 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 10 jours - étoiles: 20 - forks: 17

openalea/weberpenn

Implementation of the tree model published by Weber & Penn

langage: Python - taille: 375 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 5 - forks: 1

openalea/RSML

RSML : The language of root architecture

langage: Jupyter Notebook - taille: 9,99 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 2 - forks: 3

openalea/visualea

Visual Programming Workflow environment for OpenAlea

langage: Python - taille: 1,91 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 4 - forks: 4

openalea/scipack

Sientific Python wrappers for OpenAlea Visual Programming environment

langage: Python - taille: 15,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 1 - forks: 0

openalea/core

Core functionality of openalea

langage: Python - taille: 1,84 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 4 - forks: 8

openalea/grapheditor

A generic graph visualisation and interaction OpenAlea library

langage: Python - taille: 402 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 2 - forks: 2

openalea/hydroroot

Simulation of hydraulic root architecture

langage: Python - taille: 61,9 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 1 - forks: 3

openalea/mtg

Multiscale Tree Graph datastructure and interfaces

langage: Python - taille: 2,94 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 13 - forks: 16

openalea/openalea.rtfd.io

OpenAlea main documentation site

langage: Jupyter Notebook - taille: 73,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 5 jours - étoiles: 7 - forks: 7

openalea/PyQGLViewer Fork de fredboudon/PyQGLViewer

PyQGLViewer is a set of Python bindings for the libQGLViewer C++ library which extends the Qt framework with widgets and tools that eases the creation of OpenGL 3D viewers.

langage: Python - taille: 296 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 9 jours - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/StructureAnalysis

Plant structure analysis

langage: C++ - taille: 24,1 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 9 jours - étoiles: 6 - forks: 6

openalea/astk

Toolkit package for alinea

langage: Python - taille: 1,15 Mo - dernière synchronisation: il y a 7 jours - enregistré: il y a 9 jours - étoiles: 3 - forks: 5

openalea/lpy

An open source python version of the Lindenmayer Systems.

langage: C++ - taille: 17,8 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 10 jours - étoiles: 72 - forks: 28

openalea/plantgl

An open-source graphic toolkit for the creation, simulation and analysis of 3D virtual plants.

langage: C++ - taille: 21,6 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 10 jours - étoiles: 67 - forks: 23

openalea/caribu

Eco-physiological model of light interception by plants

langage: C - taille: 8,12 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 5 jours - étoiles: 8 - forks: 11

openalea/WALTer

WALTer is a 3D FSPM Wheat model

langage: Python - taille: 3,01 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 2 mois - étoiles: 6 - forks: 8

openalea/phenomenal

Phenomenal: An automatic open source library for 3D shoot architecture reconstruction and analysis for image-based plant phenotyping

langage: Python - taille: 43,7 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 12 jours - étoiles: 39 - forks: 16

openalea/hydroshoot

Hydroshoot model for 3D hydraulic architecture simulation

langage: Python - taille: 36,3 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 19 - forks: 11

openalea/PyRATP

RATP: Radiation Absorption, Transpiration and Photosynthesis

langage: GLSL - taille: 17,9 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 4 jours - étoiles: 5 - forks: 5

openalea/Root-CyNAPS

Root-CyNAPS : Root Cycling Nitrogen Across Plant Scales

langage: Python - taille: 73,9 Mo - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a 4 jours - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/phenotrack3d

Phenotyping Maize over time

langage: Python - taille: 111 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 5 mois - étoiles: 12 - forks: 3

openalea/fspm-utility

langage: Python - taille: 2,19 Mo - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a 28 jours - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/oawidgets

OpenAlea Widgets for Jupyter Kernel

langage: Python - taille: 71 Mo - dernière synchronisation: il y a 7 jours - enregistré: il y a environ un mois - étoiles: 4 - forks: 4

openalea/oalab

OpenAlea Laboratory

langage: Python - taille: 11,1 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 jours - étoiles: 1 - forks: 2

openalea/github-action-conda-build

A Github workflow to build your software package and publish to an Anaconda repository.

taille: 68,4 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 2 mois - étoiles: 3 - forks: 1

openalea/.github

test organisation wide issue templates

taille: 12,7 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 2 mois - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/EpyMix

A Python Model to study Epidemic dilution and barrier factors in Mixture crops

langage: Jupyter Notebook - taille: 811 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 2 mois - étoiles: 2 - forks: 0

openalea/strawberry

Strawberry architecture analysis and reconstruction

langage: Jupyter Notebook - taille: 41,8 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 mois - étoiles: 15 - forks: 7

openalea/openalea-components

Openalea components

langage: Python - taille: 51,3 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 2 mois - étoiles: 1 - forks: 7

openalea/rhizodep

RhizoDep is a functional-structural root model designed to simulate rhizodeposition processes as a function of root carbon balance.

langage: Python - taille: 107 Mo - dernière synchronisation: il y a 1 jour - enregistré: il y a 8 jours - étoiles: 4 - forks: 2

openalea/rose

Rose architecture reconstruction and light interception

langage: Python - taille: 91 Mo - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a 3 mois - étoiles: 2 - forks: 0

openalea/sconsx

SConsX is an extension package of the famous SCons build tool.

langage: Python - taille: 412 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 4 mois - étoiles: 1 - forks: 6

openalea/phenomenal_clean

cleaned version of phenomenal (purged from unused image data)

langage: Python - taille: 83,3 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 mois - enregistré: il y a 4 mois - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/phenotyping_data

Data from plant phenotyping platform primarly aimed at desmonstrating/testing opeanalea phenotyping packages

langage: Python - taille: 347 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 4 mois - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/openalea

Official repository for OpenAlea. Other repos in the openalea organization contain things like the website, documentation, projects, etc.

langage: Python - taille: 40,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 6 ans - étoiles: 51 - forks: 17

openalea/deepberry

deep-learning algorithm to detect and segment berries on grapewine images

langage: Python - taille: 70,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 5 mois - étoiles: 2 - forks: 0

openalea/agroservices

AgroService is a Python package that provides access to IPM Web Services (at least) and a framework to easily implement Web Services wrappers. This package is intended to be close to the webservice. Therefore the requests will have the same API that each web service.

langage: Python - taille: 378 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 4 jours - étoiles: 3 - forks: 4

openalea/docker-stacks

Ready-to-run Docker images containing Openalea applications

langage: Dockerfile - taille: 86,9 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 7 mois - étoiles: 4 - forks: 2

openalea/gafam

Growing AgroForestry with Apple in Mediterranean climate

langage: Jupyter Notebook - taille: 1,33 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 9 mois - étoiles: 2 - forks: 0

openalea/deploy

OpenAlea.Deploy support the installation of OpenAlea packages via the network and manage their dependencies.

langage: Python - taille: 630 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 10 mois - étoiles: 2 - forks: 7

openalea/PyCropML Fork de cyrillemidingoyi/PyCropML

CropML Python library

langage: Python - taille: 407 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 7 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/vpltk

langage: Python - taille: 411 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 1 - forks: 1

openalea/fractalysis

3D Fractal Analysis. Application to Light Interception.

langage: Python - taille: 473 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 7 ans - étoiles: 1 - forks: 1

openalea/InfraPhenoGrid

A scientific workflow infrastructure for plant phenomics on the Grid

langage: Python - taille: 74,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 9 ans - étoiles: 2 - forks: 3

openalea/braceroot

langage: Jupyter Notebook - taille: 3,71 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 3 ans - étoiles: 1 - forks: 0

openalea/eartrack

An imaging library to detect and track future position of ears on maize plants

langage: Jupyter Notebook - taille: 338 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 6 ans - étoiles: 9 - forks: 4

openalea/travis-ci Fork de StatisKit/travis-ci

Tools for Using Conda in Travis CI

langage: Shell - taille: 255 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 4 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/sigflow

Architectural Model of flowering on fruit trees

langage: Python - taille: 619 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 5 ans - étoiles: 2 - forks: 4

openalea/appveyor-ci Fork de StatisKit/appveyor-ci

Tools for Using Conda in AppVeyor CI

langage: Batchfile - taille: 185 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 5 ans - étoiles: 0 - forks: 1

openalea/plantscan3d Fork de fredboudon/plantscan3d

An open-source GUI for reconstructing plant 3D architecture from laser scans.

langage: Python - taille: 16,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 7 ans - étoiles: 1 - forks: 1

openalea/openalea-recipes

Conda recipes for OpenAlea

langage: Shell - taille: 253 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 7 ans - étoiles: 2 - forks: 6

openalea/xml_representation Fork de AgriculturalModelExchangeInitiative/Crop2ML

Repository for options to describe a model unit in a declarative way. Imperative representation will be specific for each modelling framework.

langage: Java - taille: 1,9 Mo - dernière synchronisation: il y a 5 mois - enregistré: il y a presque 7 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/container

basic common datastructures

langage: Python - taille: 31,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus d'un an - étoiles: 0 - forks: 1

openalea/plantlab

OpenAleaLab extension "plant"

langage: Python - taille: 67,4 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 7 ans - étoiles: 1 - forks: 3

openalea/misc

Miscealnous Administrative tools for OpenAlea developers

langage: Python - taille: 1,58 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 4 ans - étoiles: 0 - forks: 2

openalea/deploygui

OpenAlea graphical installer

langage: Python - taille: 142 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 7 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/oapkg

langage: Python - taille: 48,8 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 7 ans - étoiles: 0 - forks: 1

openalea/lignum

OpenAlea / Lignum interface

langage: Jupyter Notebook - taille: 769 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 8 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/provenance

Provenance related tools for openalea

langage: Python - taille: 26,4 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 8 ans - étoiles: 1 - forks: 2

openalea/conda-deploy

Scripts for OpenAlea deployment using conda and/or docker

langage: Shell - taille: 1000 octets - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 8 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/wlformat

Workflow environment definitions

langage: Python - taille: 85 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 9 ans - étoiles: 0 - forks: 1

openalea/openalea-opencv

OpenAlea workflow for OpenCV

langage: Python - taille: 84 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 9 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/PkgIt

PkgIt is a python packaging tool for Windows.

langage: Python - taille: 313 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 10 ans - étoiles: 0 - forks: 1

openalea/openalea-website

repository for sources of documentation

langage: Python - taille: 840 ko - dernière synchronisation: il y a 5 mois - enregistré: il y a presque 11 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/openalea.github.io

build pages of th documentation

langage: JavaScript - taille: 246 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 11 ans - étoiles: 0 - forks: 0

openalea/scanalea

Transition layer between PlantScan project and OpenAlea

langage: Python - taille: 1,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 11 ans - étoiles: 3 - forks: 5